呼和浩特海關是國家批準設立的進出境監(jiān)督管理機關，依照《中華人民共和國海關法》和其它有關法律、法規(guī)，監(jiān)管關區(qū)內的進出境運輸工具、貨物、行李物品、郵遞物品和其它物品，征收關稅和其它稅費，查緝走私、編制海關統(tǒng)計和辦理其它海關業(yè)務。呼和浩特海關業(yè)務轄區(qū)為內蒙古自治區(qū)中西部的呼和浩特市、包頭市、鄂爾多斯市、烏海市、巴彥淖爾市、烏蘭察布市及錫林郭勒盟、阿拉善盟8個盟（市），面積72萬平方公里，邊境線長2,400多公里，海關管理格局總體呈現“點多、線長、面廣”的特點。轄區(qū)分布有呼和浩特國際航空港、鄂爾多斯國際航空港、二連鐵路、二連公路、珠恩嘎達布其、甘其毛都、滿都拉、策克7個常年對外開放口岸，二連浩特機場、包頭機場連續(xù)實現臨時開放。

20世紀80年代中后期，被稱為內蒙古“金三角”的呼和浩特市、包頭市、鄂爾多斯市外向型經濟發(fā)展迅猛，為方便該地區(qū)企業(yè)辦理進出口手續(xù)，國務院批準成立呼和浩特海關，1991年7月6日正式掛牌并對外開辦業(yè)務。

地處北疆、背靠京津、面向俄蒙的區(qū)位優(yōu)勢，國家西部大開發(fā)政策和提升沿邊開放水平的大潮流，使得呼和浩特海關在國家和內蒙古自治區(qū)向北開放戰(zhàn)略格局中處于重要位置，已逐步發(fā)展成為監(jiān)管區(qū)域廣、口岸數量多、業(yè)務門類全的綜合型海關。監(jiān)管口岸涵蓋陸、空，運輸工具包括空運航空器、陸運列車和汽車、跨境皮帶，貿易方式有一般貿易、邊境小額貿易、加工貿易等。海關業(yè)務的快速發(fā)展，有力推動了邊境地區(qū)城鎮(zhèn)化發(fā)展進程，確保了邊境地區(qū)經濟繁榮、社會穩(wěn)定。1991年至2017年，關區(qū)監(jiān)管貨運量從36.3萬噸增加到5310.5萬噸，稅收從0.92億元增加到83.6億元，關區(qū)各項工作保持了全面、協調、持續(xù)發(fā)展的良好勢頭。

自1955年集寧關成立，60多年來，呼和浩特海關幾代邊關人大力弘揚“忠誠公正、興關強國”的海關精神，傳承“熱血守邊關、風雪鑄忠魂”的優(yōu)良傳統(tǒng)，在杳無人煙的荒原、在風沙漫舞的戈壁、在冰封雪裹的高原，常年與心靈上的寂寞和對親人的思念為伴，與狂風、暴雪、高寒斗爭，如同額濟納河畔矗立千年的胡楊，如同大漠戈壁中風化萬年的磐石，如同二連浩特國門下見證滄桑的界碑，扎根邊關、艱苦創(chuàng)業(yè)，把關戍邊、恪盡職守，在72萬平方公里的大漠草原上譜寫了一曲“特別能吃苦、特別能戰(zhàn)斗、特別能忍耐、特別能奉獻、特別能團結”的特色邊關之歌。

2017年，呼和浩特海關新一屆黨組成立，關區(qū)改革發(fā)展站上新的歷史起點。我們將全面貫徹落實黨的十九大精神，在新一屆黨組的帶領下，堅守邊關，奮楫前行，以黨建廉建凝聚全關力量，以學習借鑒增強執(zhí)法本領，以改革創(chuàng)新實現跨越發(fā)展，為海關事業(yè)，為國家政治、經濟、社會、生態(tài)發(fā)展與安全做出應有的貢獻！

十三屆全國人大一次會議審議通過的《國務院機構改革方案》明確“原國家質量監(jiān)督檢驗檢疫總局的出入境檢驗檢疫管理職責和隊伍劃入海關總署”，目前轉隸組建正式完成，機構職能、組織機構相關信息待新“三定”方案后更新。