內蒙古自治區(qū)教育廳是自治區(qū)人民政府組成部門，為正廳級。中共內蒙古自治區(qū)教育工作委員會為自治區(qū)黨委的派出機構，與自治區(qū)教育廳合署辦公。

內蒙古自治區(qū)黨委教育工作領導小組秘書組設在自治區(qū)教育廳，接受自治區(qū)黨委教育工作領導小組的直接領導，承擔領導小組具體工作，組織研究教育領域黨的建設和思想政治建設政策、教育發(fā)展戰(zhàn)略規(guī)劃、重大改革方案，協(xié)調督促落實領導小組工作部署和要求等。設置自治區(qū)黨委教育工作領導小組秘書組秘書處，負責處理領導小組秘書組日常事務。自治區(qū)教育廳的內設機構根據工作需要承擔領導小組秘書組相關工作，接受領導小組秘書組的統(tǒng)籌協(xié)調。

自治區(qū)教育廳（教育工委）貫徹落實黨中央關于教育工作的方針政策和自治區(qū)黨委相關決策部署，在履行職責過程中堅持和加強黨對教育工作的集中統(tǒng)一領導。主要職責包括：

貫徹執(zhí)行黨的教育工作方針政策和國家法律法規(guī)，擬訂自治區(qū)教育改革發(fā)展戰(zhàn)略和教育事業(yè)發(fā)展規(guī)劃，起草相關地方性法規(guī)、規(guī)章草案并監(jiān)督實施。

負責各級各類教育的統(tǒng)籌規(guī)劃和協(xié)調管理，會同有關部門研究制定中等、初等教育各類學校的設置標準。指導各級各類學校的教育教學改革。

負責推進義務教育均衡發(fā)展和促進教育公平，指導普通高中教育、學前教育、民辦基礎教育和特殊教育工作。制定基礎教育教學基本要求和教學基本文件，組織審定中等和初等地方課程教材。指導中小學校外教育和安全管理，實施素質教育，構建德智體美勞全面培養(yǎng)的教育體系。

制定中等職業(yè)教育教學指導文件和教學評估要求并組織實施。指導中等職業(yè)教育、成人教育教材建設，組織審定地方教材，開展職業(yè)指導工作。統(tǒng)籌民辦中等職業(yè)教育、職工教育、農牧民教育、社區(qū)教育、終身教育、老年教育等各類成人教育。

負責統(tǒng)籌規(guī)劃自治區(qū)高等學?！半p一流”建設，協(xié)調部區(qū)合建高校工作。制定高等教育教學指導文件。研究提出高等學校設置、調整的意見。負責高等學校專業(yè)設置、調整工作。統(tǒng)籌指導各類高等教育和繼續(xù)教育，組織指導高等教育評估工作，深化高校管理體制改革。

負責組織對各級各類教育的督導檢查和評估驗收工作。組織開展基礎教育發(fā)展水平和質量監(jiān)測工作，發(fā)布教育督導報告。

負責本部門教育經費的統(tǒng)籌管理，參與擬訂教育經費籌措使用管理政策。監(jiān)測教育經費使用情況，負責統(tǒng)計全區(qū)教育經費執(zhí)行情況。組織開展各級各類學校學生資助工作。

規(guī)劃并指導各級各類學校黨的建設、思想政治和意識形態(tài)工作。指導高校統(tǒng)一戰(zhàn)線和群團組織工作。指導各類學校德育工作、體育衛(wèi)生與健康教育、藝術與勞動教育以及國防教育工作。指導全區(qū)教育系統(tǒng)文明校園建設和校園文化建設工作。

主管全區(qū)教師工作，統(tǒng)籌管理教育系統(tǒng)人才工作。指導各級各類學校教師、中小學校長和教育行政干部隊伍的建設工作。指導各類教師招聘、崗位聘任管理、職稱評審工作。組織實施教師資格制度、教師培訓和教師繼續(xù)教育工作。

負責各類高等學歷教育招生考試和學籍學歷管理工作，研究擬訂各類高等教育招生計劃。負責高校學生申訴處理工作。參與擬訂普通高等學校畢業(yè)生就業(yè)創(chuàng)業(yè)政策，指導普通高等學校開展大學生就業(yè)、創(chuàng)業(yè)創(chuàng)新和服務工作。

統(tǒng)籌規(guī)劃高等學校科學技術應用研究與推廣、科研成果轉化和產學研結合工作。統(tǒng)籌協(xié)調高等學校參與國家和自治區(qū)創(chuàng)新體系建設以及各類科技計劃。指導高等學校科技創(chuàng)新平臺的發(fā)展建設和圖書館建設工作。

指導全區(qū)教育科學研究、教育教學研究、教育技術裝備工作。統(tǒng)籌推進教育信息化建設工作。

指導協(xié)調教育系統(tǒng)維護穩(wěn)定及安全管理工作。指導高校后勤管理與改革工作。

組織指導教育系統(tǒng)對外合作與交流，開展與港澳臺地區(qū)的教育合作交流。

貫徹落實國家語言文字工作方針政策，編制自治區(qū)國家通用語言文字工作的中長期規(guī)劃。指導普通話應用和水平培訓測試以及普通話師資培訓工作。會同有關部門指導教育系統(tǒng)少數民族語言文字規(guī)范化工作。

統(tǒng)籌規(guī)劃學位與研究生教育工作，實施國家學位制度，按規(guī)定權限負責增設學位授予單位和增設學位授權學科、專業(yè)的申報、審核、審批工作。

內蒙古自治區(qū)教育廳（教育工委）設下列內設機構：

辦公室（教育工委辦公室）、人事處（教育工委組織部）、教育工委宣傳部（教育工委統(tǒng)戰(zhàn)部）、政策法規(guī)處（綜合改革辦公室）、發(fā)展規(guī)劃處、財務處、基礎教育處、職業(yè)教育與成人教育處、高等教育處、督導室、教師工作處、學生工作處、教材處、學校安全管理處、體育衛(wèi)生藝術與勞動教育處、科學技術與信息化處、學位管理與研究生教育處、語言文字應用管理處、合作交流處、校外教育培訓監(jiān)管處、機關黨委（自治區(qū)教育廳黨組巡察工作領導小組辦公室）、離退休人員工作處。