（一） 辦公室（財務(wù)科）。負責機關(guān)日常運轉(zhuǎn)；組織制定機關(guān)內(nèi)部管理制度；負責文電、會務(wù)、檔案、機要、保密、安全、信訪、新聞宣傳等工作；聯(lián)系特約審計員；負責財務(wù)和國有資產(chǎn)管理工作；負責局機關(guān)及所屬事業(yè)單位干部人事管理、機構(gòu)編制、勞動工資、教育培訓等工作；負責機關(guān)和所屬事業(yè)單位黨群工作；負責離退休人員服務(wù)管理工作；負責處理市委審計委員會辦公室日常事務(wù)。

（二） 法規(guī)科。組織實施審計相關(guān)地方性法規(guī)和政府規(guī)章；承擔規(guī)范性文件審核工作；負責起草審計業(yè)務(wù)管理及內(nèi)部控制規(guī)定；負責審計項目計劃、審計統(tǒng)計工作；組織開展審計整改監(jiān)督檢查工作；組織起草審計查出問題整改情況報告；組織起草審計結(jié)果公告；組織對機關(guān)預算執(zhí)行情況、決算草案和其他財政收支的內(nèi)部審計；承擔審計行政復議、行政應訴等工作；負責法治宣傳教育工作。

（三） 審理科。審理有關(guān)審計業(yè)務(wù)事項，監(jiān)督檢查下級審計機關(guān)的審計業(yè)務(wù)質(zhì)量，糾正或責成糾正下級審計機關(guān)違反國家規(guī)定作出的審計決定，負責對重大違紀違法問題線索的移送協(xié)調(diào)；推動建立健全內(nèi)部審計制度，指導和監(jiān)督內(nèi)部審計工作，組織協(xié)調(diào)對社會審計機構(gòu)出具的相關(guān)報告的核查。

（四） 電子數(shù)據(jù)審計科。組織開展審計業(yè)務(wù)電子數(shù)據(jù)的采集、驗收、整理和綜合分析利用，組織對有關(guān)部門和國有企事業(yè)單位網(wǎng)絡(luò)安全、電子政務(wù)工程和信息化項目以及信息系統(tǒng)的審計。 

（五） 財政審計科。組織審計國家、自治區(qū)和市有關(guān)重大政策措施貫徹落實情況；組織審計市級預算執(zhí)行情況、決算草案和其他財政收支以及縣（區(qū)）政府財政預算執(zhí)行情況、決算草案和其他財政收支，財政轉(zhuǎn)移支付資金。 

（六） 行政事業(yè)審計科。組織審計市黨政機構(gòu)、事業(yè)單位、社會團體財政財務(wù)收支。

（七） 固定資產(chǎn)投資審計科。組織審計政府投資建設(shè)項目的預算執(zhí)行情況和決算、資金管理使用和建設(shè)運營情況。

（八） 自然資源和生態(tài)環(huán)境審計科（農(nóng)業(yè)農(nóng)村審計科）。組織開展領(lǐng)導干部自然資源資產(chǎn)離任審計以及自然資源管理、污染防治和生態(tài)保護與修復情況審計；組織審計農(nóng)業(yè)農(nóng)村、扶貧開發(fā)以及相關(guān)公共資金和建設(shè)項目。

（九） 企業(yè)審計科。組織審計市國有企業(yè)及國有資本占控股地位或者主導地位的企業(yè)和金融機構(gòu)的資產(chǎn)、負債、損益以及財務(wù)收支；組織審計市駐外非經(jīng)營性機構(gòu)的財務(wù)收支。

（十） 社會保障審計科。組織審計市相關(guān)部門管理和其他單位受市人民政府及其他部門委托管理的社會保障基金、社會捐贈資金以及其他有關(guān)基金、資金的財務(wù)收支。

（十一） 經(jīng)濟責任審計科。組織對全市由市委組織部管理的黨政主要領(lǐng)導干部、國有企事業(yè)單位主要領(lǐng)導人員和縣（區(qū)）審計機關(guān)主要負責人的經(jīng)濟責任審計。

（十二） 派出審計科。根據(jù)市審計局的授權(quán)和安排，依據(jù)《中華人民共和國審計法》對貢覺縣、邊壩縣在法定職權(quán)范圍內(nèi)進行審計，出具審計報告，作出審計決定或向有關(guān)主管部門提出處理處罰建議。