1、研究、擬訂對臺工作方針政策；貫徹執(zhí)行黨中央、國務(wù)院確定的對臺工作的方針政策。

2、組織、指導(dǎo)、管理、協(xié)調(diào)黨中央、國務(wù)院各部門和各省、自治區(qū)、直轄市的對臺工作；檢查了解各地區(qū)、各部門貫徹執(zhí)行黨中央、國務(wù)院對臺方針政策情況。

3、研究臺灣形勢和兩岸關(guān)系發(fā)展動向；協(xié)調(diào)有關(guān)部門研究、草擬涉臺的法律、法規(guī),統(tǒng)籌協(xié)調(diào)涉臺法律事務(wù)。

4、按照黨中央、國務(wù)院的部署和授權(quán),負責同臺灣當局及其授權(quán)社會團體談判及簽署協(xié)議文件的有關(guān)準備工作。

5、管理協(xié)調(diào)兩岸通郵、通航、通商事務(wù)；負責對臺宣傳、教育工作和有關(guān)臺灣工作的新聞發(fā)布；處理涉臺的重大事件。

6、會同有關(guān)部門統(tǒng)籌協(xié)調(diào)和指導(dǎo)對臺經(jīng)貿(mào)工作和兩岸金融、文化、學術(shù)、體育、科技、衛(wèi)生等各個領(lǐng)域的交流與合作,以及兩岸人員往來、考察、研討等工作,國際會議的涉臺工作。

7、完成黨中央、國務(wù)院交辦的其他任務(wù)。

根據(jù)工作職責，中共中央臺灣工作辦公室、國務(wù)院臺灣事務(wù)辦公室內(nèi)設(shè)12個局級機構(gòu)，分別是:秘書局、綜合局、研究局、新聞局、經(jīng)濟局、港澳涉臺事務(wù)局、交流局、聯(lián)絡(luò)局、法規(guī)局、投訴協(xié)調(diào)局、政黨局，機關(guān)黨委（人事局）。機關(guān)紀委與機關(guān)黨委（人事局）合署辦公。