本溪海關是受大連海關直接領導的正處級隸屬海關。功能類型為屬地型，管轄范圍為：本溪市。主要負責黨的基層組織建設和干部隊伍日常管理；辦理具體海關業(yè)務，反饋執(zhí)法作業(yè)結果；完成大連海關交辦的其他工作。

按照國務院機構改革工作部署，原出入境檢驗檢疫職能和隊伍劃入海關。截至目前，本溪海關內(nèi)設機構和人員調(diào)整已到位。本溪海關受大連海關直接領導，負責本溪轄區(qū)的通關管理工作。具體承擔轄區(qū)進出境貨物及物品的通關監(jiān)管、出入境檢驗檢疫及監(jiān)督管理、征收關稅和其他稅費、查緝走私、編制海關統(tǒng)計等工作。

本溪海關內(nèi)設辦公室、綜合業(yè)務科、查檢科3個正科級機構。

按照機構改革要求，我關結合具體情況對各內(nèi)設機構的工作職責進行了合理劃分，原遼寧出入境檢驗檢疫局本溪辦事處和原大連海關駐本溪辦事處各科室工作內(nèi)容已重新整合優(yōu)化。為便于企業(yè)辦理進出口通關手續(xù)，現(xiàn)將涉企相關的科室名稱、簡要職責、辦公地點及時間予以公布。