深圳特辦由商務部指派的特派員領(lǐng)導。 

深圳特辦下設(shè)： 

1、辦公室 負責深圳特辦日常行政工作、財務、對外聯(lián)絡(luò)和后勤服務工作；

2、調(diào)研處 收集深圳內(nèi)外貿(mào)、外經(jīng)、外資等經(jīng)濟工作的重要商務信息并及時上報商務部；圍繞商務部各個時期的工作重點，在當?shù)亻_展有針對性的調(diào)研工作；客觀、真實地將當?shù)厣虅展ぷ髦写嬖诘膯栴}及當?shù)仄髽I(yè)存在的帶有普遍性的問題反映到商務部；負責深圳特辦網(wǎng)站欄目信息的發(fā)布、更新和維護工作。

3、業(yè)務處 負責簽發(fā)供港、澳地區(qū)（陸運）鮮活出口許可證和簽發(fā)部分深圳市企業(yè)的進出口許可證。 

商務部駐深圳特派員辦事處，簡稱深圳特辦，于1988年5月15日成立。 

深圳特辦事是商務部派駐深圳行使部分政府行政職能的機構(gòu)，受商務部領(lǐng)導，并向商務部負責。 

一、落實商務發(fā)展政策法規(guī)和要求 

（一）檢查深圳地區(qū)的商務主管部門、中介組織和企業(yè)貫徹執(zhí)行國家國內(nèi)外貿(mào)易、外商投資和國際經(jīng)濟合作法律法規(guī)、方針政策的情況。 

（二）及時反映各項商務政策措施出臺或調(diào)整后，在深圳地區(qū)的實施情況及意見。 

〈三）監(jiān)督檢查深圳地區(qū)各項商務發(fā)展規(guī)劃、商務標準的執(zhí)行情況，促進商務規(guī)劃的執(zhí)行和標準體系建設(shè)工作。 

二、加強與深圳地區(qū)的工作聯(lián)系和溝通 

（四）加強特派員辦事處與深圳地方黨委及人民政府、商務主管部門以及海關(guān)、稅務、工商、質(zhì)檢等部門的工作聯(lián)系。 

（五）建立同深圳貿(mào)工局的工作聯(lián)系機制，研究解決地方商務發(fā)展中的問題。出席、列席當?shù)厝嗣裾蜕虅罩鞴懿块T的相關(guān)會議。 

（六）建立特派員辦事處向深圳地區(qū)人民政府工作通報制度。 

（七）協(xié)助深圳地區(qū)做好同商務部各直屬單位、商會、協(xié)會、學會和駐外經(jīng)濟商務機構(gòu)的各項聯(lián)系合作。 

（八）協(xié)助相關(guān)司局做好全國人大代表建議和全國政協(xié)委員提案的聯(lián)系、溝通和辦理工作。 

三、推動各項商務重點工作的開展和落實 

（九）商務部在深圳地區(qū)推動的重點工程，作為項目管理單位參加相關(guān)工作。 

（十）監(jiān)督檢查商務部重點工程在深圳的開展情況，總結(jié)深圳的經(jīng)驗，及時發(fā)現(xiàn)、報告、排查、解決問題。 

（十一）了解各類中央促進資金支持深圳商務發(fā)展項目情況進度，受商務部委托監(jiān)督項目專項資金管理及使用情況。 

四、認真做好為深圳的服務，為深圳發(fā)展辦實事 

（十二）及時向商務部反映深圳商務發(fā)展情況，特別是深圳迫切希望商務部幫助解決的問題。 

（十三）積極參與和支持深圳商務發(fā)展重要工作和重大項目。 

（十四）加強同商務部地方工作聯(lián)系機制協(xié)作組的配合，共同，落實為深圳辦實事。 

（十五）落實好商務部同深圳商定的具體項目和工作。 

（十六）建立商務政策定期宣傳工作機制，給深圳商務主管部門和企業(yè)提供咨詢和指導。 

（十七）在特辦設(shè)立公共商務信息服務站點，提供公共商務信息服務。 

五、加強市場運行動態(tài)監(jiān)測，推動市場體系建設(shè) 

（十八）建立深圳地區(qū)重要消費品及主要生產(chǎn)資料的市場運行動態(tài)、價格波動、儲備及進出口情況月報告制度。 

（十九）及時分析市場運行特點、發(fā)展趨勢和焦點問題，及時掌握和報告重大市場動態(tài)。 

（二十）積極推動城市商業(yè)發(fā)展規(guī)劃、國內(nèi)貿(mào)易發(fā)展和農(nóng)村市場體系建設(shè)工作。 

（二十一）協(xié)助商務部和深圳商務主管部門打破地區(qū)封鎖，維護公平競爭秩序，推進商務信用體系建設(shè)工作。 

（二十二）配合做好處理深圳知識產(chǎn)權(quán)舉報投訴服務中心的建設(shè)、管理、運行以及案件的跟蹤督辦工作。 

六、積極促進深圳區(qū)域協(xié)調(diào)發(fā)展 

（二十三）結(jié)合自身特點，為深圳地區(qū)的區(qū)域發(fā)展服務。 

（二十四）加強與部機關(guān)有關(guān)司局和駐外經(jīng)商機構(gòu)的聯(lián)系與合作，為深圳企業(yè)開拓國際市場提供幫助。 

（二十五）通過舉辦研討會、座談會等方式，為區(qū)域經(jīng)濟協(xié)調(diào)發(fā)展搭建平臺。 

七、協(xié)助做好展會工作 

（二十六）參與商務部在深圳主辦的各類展會活動，做好承辦單位與部機關(guān)的聯(lián)系協(xié)調(diào)工作。 

八、進出口商品許可證發(fā)放和管理工作 

（二十七）簽發(fā)深圳地區(qū)部分進出口許可證、自動進出口許可證或其他進出口許可證件，接受商　務部相關(guān)單位的業(yè)務指導。 

九、調(diào)研和信息報送工作 

（二十八）掌握深圳地區(qū)經(jīng)濟發(fā)展的基本情況，調(diào)查研究深圳商務發(fā)展狀況和工作中存在的問題，反映和分析商務重點工程在深圳實施中的突出問題，提出切實可行的建議。 

（二十九）及時反映深圳商務發(fā)展中的突發(fā)事件和熱點、難點、焦點問題。 

（三十）承擔商務部及各司局布置的各項專項調(diào)研任務。 

十、代表商務部出席守參加有關(guān)商務活動 

（三十一）受商務部或有關(guān)司局委托；出席深圳有關(guān)重要商務活動，協(xié)調(diào)處理深圳有關(guān)商務工作。 

十一、辦理商務部交辦的其他事項