一、主要職責：

連云港海關是受南京海關直接領導，按授權負責指定口岸和區(qū)域范圍內海關各類管理工作的正處級隸屬海關，領導隸屬海關辦事處。連云港海關管轄范圍為連云港市的各項海關管理工作。主要職責是：負責黨的基層組織建設和干部隊伍建設；辦理具體海關業(yè)務，反饋執(zhí)法作業(yè)結果；完成南京海關交辦的其他工作。

二、機構設置：

（一）內設21個科級機構：

辦公室（黨委辦公室）、人事政工科（黨委組織宣傳部）、財務科、技術科、法規(guī)科、綜合業(yè)務科、查驗一科、查驗二科、查驗三科、查驗四科、關稅科、統(tǒng)計分析科、旅檢一科、旅檢二科、快件監(jiān)管科、特殊區(qū)域管理科、稽查科、企業(yè)管理科、保稅監(jiān)管科、督察內審科、業(yè)務運行監(jiān)控科。

（二）下設2個副處級機構（12個科級機構）：

駐港區(qū)辦事處下設7個科級機構：綜合業(yè)務科、監(jiān)管一科、監(jiān)管二科、物流管理科、運輸工具監(jiān)管一科、運輸工具監(jiān)管二科、運輸工具監(jiān)管三科；

駐贛榆辦事處下設5個科級機構：綜合業(yè)務科、監(jiān)管科、貨物查驗一科、貨物查驗二科、運輸工具監(jiān)管科。